| Peptide Calculator Abbreviations | |||
|---|---|---|---|
| Abbr. | Mol. Formula | MF Additive used if abbr. isn't followed with ( | Note |
| 1Nal | C13H10NO | H | beta-(1-naphtyl)alanine |
| 2Bip | C15H12NO | H | 2-(phenyl)phenylalanine |
| 2Bpa | C16H12NO2 | H | Benzoyl-phenylalanine |
| 2Nal | C13H10NO | H | beta-(2-naphtyl)alanine |
| 2Pal | C8H8N2O | beta-(2-pyridyl)alanine | |
| 3Bip | C15H12NO | H | 3-(phenyl)phenylalanine |
| 3Bpa | C16H12NO2 | H | Benzoyl-phenylalanine |
| 3Pal | C8H8N2O | beta-(3-pyridyl)alanine | |
| 4Bip | C15H12NO | H | 4-(phenyl)phenylalanine |
| 4Bpa | C16H12NO2 | H | Benzoyl-phenylalanine |
| 4Pal | C8H8N2O | beta-(4-pyridyl)alanine | |
| A2bu | C4H07N2O | H | |
| A2pr | C3H05N2O | H | |
| Aaa | C12H17O | ||
| Aad | C6H8NO2 | OH | alpha-aminoadipic_acid |
| Abu | C4H07NO | aminobutyric_acid | |
| Aca | C6H11NO | aminocaproic_acid | |
| Ac | C2H03O | Acetyl | |
| acet | C2H02O4 | ||
| Acm | C3H06NO | ||
| Acr | C13H07N | H | Acridine-yl |
| Ada | C10H15 | ||
| Adoc | C11H15O2 | ||
| Adpo | C14H21O2 | ||
| Ag | Ag | ||
| Agl | C2H3N2O | H | alpha-amino-glycine |
| Ahx | C6H11NO | ||
| Aib | C4H6NO | H | alpha-aminoisobutyric_acid |
| Ala | C3H05NO | ||
| Ala | C3H05NO | ||
| Al | Al | ||
| All | C3H4 | H | |
| Alloc | C4H4O2 | H | |
| Ape | C5H09NO | ||
| Apm | C7H10NO2 | O | |
| Ar | Ar | ||
| Arg | C6H11N4O | H | |
| As | As | ||
| Asi | C4H2NO | OH | aspartimide_tautomeric_substitution_of_OH |
| Asn | C4H05N2O2 | H | |
| Asp | C4H04NO2 | OH | |
| Asu | C8H12NO2 | OH | aminosuberic_acid |
| Au | Au | ||
| Aze | C4H4NO | H | azetidine-2-carboxylic_acid |
| Ba | Ba | ||
| bAla | C3H05NO | ||
| B | B | ||
| Be | Be | ||
| Bi | Bi | ||
| Bip | C15H12NO | H | x-(phenyl)phenylalanine |
| BO2H2 | BH2O2 | ||
| Boc | C5H09O2 | tert.-butyl oxy carbonyl | |
| Bom | C8H09O | ||
| Bpa | C16H12NO2 | H | Benzoyl-phenylalanine |
| Bpoc | C16H15O2 | ||
| Br2 | Br2 | ||
| Br | Br | ||
| Bu4N | C16H35N | H | tetra-butyl-ammonium |
| Bum | C5H11O | ||
| But | C4H09 | ||
| ButS | C4H09S | ||
| BzBr | C7H06Br | ||
| Bzl | C7H6 | H | Benzyl |
| C2H2 | C2H02 | ||
| C2H4 | C2H04 | ||
| C2H5 | C2H05 | ||
| C2H5 | C2H5 | ||
| C3H7 | C3H7 | ||
| Ca | Ca | ||
| cAMP | C10H12N5O6P | CyclicAdenosinemonophosphate | |
| c | |||
| C | C | ||
| Cd | Cd | ||
| Ce | Ce | ||
| CH2 | CH02 | ||
| CH2CH2 | C2H04 | ||
| CH2CH2CH2 | C3H06 | ||
| CH2CH2CH2CH2 | C4H8 | ||
| CH2CO | C2H2O | ||
| CH2COOH | C2H3O2 | ||
| CH2S | CH02S | ||
| CH3 | CH03 | ||
| CHA | C6H13N | ||
| Cha | C9H15NO | ||
| CH | CH | ||
| CHCH | C2H02 | ||
| Chg | C8H12NO | H | cyclohexyl-glycine |
| CHO | CHO | ||
| cHx | C6H11 | ||
| Chx | C6H11 | ||
| CinMKet | C11H12O | ||
| Cit | C6H10N3O2 | H | Citruline |
| Cl | Cl | ||
| CN4 | CN4 | ||
| CN | CN | ||
| CNOH | CHNO | ||
| CO | CO | ||
| Co | Co | ||
| CONH2 | CH2NO | ||
| COO | CO2 | ||
| COOH | CHO2 | ||
| Cpp | C8H12OS | ||
| Cr | Cr | ||
| Cs | Cs | ||
| CSNH | CHNS | ||
| Cu | Cu | ||
| Cyc | C7H10NO2S | ||
| cyclo | |||
| Cys | C3H04NOS | H | |
| Dab | C4H07N2O | H | |
| Dap | C3H5N2O | H | 2,3-diaminopropionic_acid |
| D | |||
| DCBz | C7H05Cl2 | ||
| DCHA | C12H23N | ||
| Dde | C10H13O2 | ||
| Ddz | C12H15O2 | ||
| Dep | C7H12OS | ||
| Dha | C3H3NO | dehydroalanine | |
| Dhp | C5H4NO | H | dehydroproline |
| DMAP | C7H9N2 | H | Dimethylaminopyridine |
| Dmob | C9H11O2 | dimethoxybenzyl | |
| Dmp | C5H08OS | ||
| DMSO | C2H6SO | ||
| Dnp | C6H03N2O4 | ||
| Dns | C12H12NO2S | ||
| DOSAPBn | C22H34N5O7P | HO | DOSA-PBn_w/o_H_at_NH2 |
| Dpr | C3H05N2O | H | |
| Dy | Dy | ||
| EDTAd | C10H12N2O6 | H2 | EDTA_di_subst_w/o_2xOH |
| EDTAm | C10H13N2O7 | H2 | EDTA_mono_subst_w/o_OH |
| EDTAq | C10H12N2O4 | EDTA_qutro_subst_w/o_4xOH | |
| EDTAt | C10H13N2O5 | EDTA_tri_subst_w/o_3xOH | |
| EnMEth | C12H14O | ||
| Er | Er | ||
| Et | C2H05 | ||
| Eu | Eu | ||
| Fe | Fe | ||
| F | F | ||
| Fme | C14H11 | ||
| Fmoc | C15H11O2 | ||
| FmoF | C18H19NO2 | ||
| For | CHO | ||
| Ga | Ga | ||
| Gd | Gd | ||
| Ge | Ge | ||
| Gla | C6H5NO3 | O2H2 | gamma-carboxyglutamic_acid |
| Gln | C5H07N2O2 | H | |
| Glp | C5H06NO2 | ||
| Glu | C5H06NO2 | OH | |
| Gly | C2H03NO | ||
| H2O | H02O | ||
| Har | C7H13N4O | H | |
| HBr | HBr | ||
| Hcc | C7H10NO2S | ||
| Hci | C7H12N3O2 | H | Homocitruline |
| HCl | HCl | ||
| Hcy | C4H6NOS | H | Homocysteine |
| He | He | ||
| Hf | Hf | ||
| Hg | Hg | ||
| H | H | ||
| His | C6H06N3O | H | |
| Ho | Ho | ||
| Hph | C10H10NO | H | Homophenylalanine |
| Hse | C4H06NO2 | H | |
| Hsl | C4H06NO2 | ||
| Hyl | C6H11N2O2 | H | delta-hydroxy-lysine |
| Hyp | C5H6NO2 | H | Hydroxyproline |
| iAm | C5H10 | H | iso-amyl |
| iGln | C5H08N2O2 | H | |
| I | I | ||
| Ile | C6H11NO | ||
| Ind | C8H5N | H | Indole-yl |
| In | In | ||
| iPr | C3H6 | H | |
| Ir | Ir | ||
| Iva | C5H09O | ||
| K | K | ||
| Kr | Kr | ||
| La | La | ||
| Lau | C12H23O | ||
| L | |||
| Leu | C6H11NO | ||
| Li | Li | ||
| Lu | Lu | ||
| Lys | C6H11N2O | H | |
| Mbh | C15H15O2 | ||
| Mbs | C7H07O3S | ||
| Me3Si | C3H8Si | H | |
| Me | CH3 | ||
| Meob | C8H09O | ||
| MeOB | C8H09O | ||
| Met | C5H09NOS | ||
| Mg | Mg | ||
| Mmt | C20H17O | ||
| Mn | Mn | ||
| Mob | C8H09O | ||
| Mo | Mo | ||
| Mpa | C3H04OS | ||
| mpeg2000 | C91H183O46 | CH3-O-(C2H40)45- | |
| mPEG2000 | C91H183O47 | CH3-O-(C2H40)45-O- | |
| mpeg5000 | C227H455O113 | CH3-O-(C2H4O)113- | |
| mPEG5000 | C227H455O114 | CH3-O-(C2H4O)113-O- | |
| mPEG750 | C33H67O16 | mPEG750-OH | |
| Mpr | C3H04OS | ||
| Mtr | C10H13O3S | ||
| Mts | C9H11O2S | ||
| Mtt | C20H17 | ||
| Mur | C9H15NO6 | ||
| Myr | C14H27O | ||
| Nal | C13H10NO | H | naphtylalanine |
| Na | Na | ||
| Nb | Nb | ||
| Nd | Nd | ||
| Ne | Ne | ||
| NH2 | H02N | ||
| NH | HN | ||
| NHCH2CH2NH | C2H06N2 | ||
| NHCH2CH2OH | C2H6NO | ||
| Ni | Ni | ||
| Nle | C6H10NO | H | norleucine |
| NMe2 | C2H06N | ||
| N | N | ||
| NO2 | NO2 | ||
| Nps | C6H04NO2S | ||
| Npys | C5H03N2O2S | ||
| Nva | C5H08NO | H | norvaline |
| O2 | O2 | ||
| OAll | C3H4O | H | |
| OBut | C4H09O | ||
| OBz | C7H07O | ||
| OBzl | C7H6O | H | |
| OCH2CH2NH | C2H05NO | ||
| OCH2CO | C2H2O2 | ||
| OCH2COOH | C2H3O3 | ||
| OChx | C6H11O | ||
| ODhb | C7H14N3O2 | ||
| OFm | C14H11O | ||
| OH | HO | ||
| Oic | C9H12NO | H | octahydroindole-2-carboxylic_acid |
| OMe | CH03O | ||
| O | O | ||
| OPcp | C6OCl5 | ||
| OPfp | C6F4 | F | Ester_pfp |
| OPh | C6H4O | H | |
| Orn | C5H09N2O | H | |
| Os | Os | ||
| OSu | C4H04NO3 | ||
| OtBu | C4H09O | ||
| Pal | C8H8N2O | beta-(x-pyridyl)alanine | |
| Pa | Pa | ||
| Pap | C9H9N2O | H | p-Amino-phenylalanine |
| Pbf | C13H17O3S | ||
| Pb | Pb | ||
| Pd | Pd | ||
| peg1000 | C46H90O22 | -(C2H4O)22-CH2CH2- | |
| peg2000 | C90H180O44 | -(C2H4O)44-CH2CH2- | |
| PEG2000 | C90H180O45 | -(C2H4O)45- | |
| peg6000 | C272H544O135 | HO-PEG6000-OH | |
| PEG6000 | C272H544O136 | H-PEG6000-OH | |
| Pen | C5H8NOS | H | Penicilamine |
| Pfp | C6F4 | F | Pentafluorphenol |
| pGlu | C5H06NO2 | ||
| Ph | C6H4 | H | |
| Phe | C9H08NO | H | |
| Phg | C8H6NO | H | phenylglycine |
| PhO | C6H4O | H | |
| pik | C6H3N3O7 | Pikrova_kyselina | |
| pMB | C8H09 | ||
| Pmc | C14H19O3S | ||
| PmoA | C8H13NO2 | ||
| Pmp | C8H12OS | ||
| PmsA | C8H13NOS | ||
| Pms | C11H15O2S | ||
| P | P | ||
| Pra | C5H4NO | H | propargyl-glycine |
| Pro | C5H07NO | ||
| Pr | Pr | ||
| Pt | Pt | ||
| Py | C5H3N | H | Subst_pyridyl |
| py | C5H4N | H | Subst_pyridine |
| Pyr | C5H4NO2 | H | pyroglutamic_acid |
| Qui | C14H8NOCl | H | 6-Chloro-2-methoxyacridin-9-yl |
| Rb | Rb | ||
| Re | Re | ||
| Rh | Rh | ||
| Ru | Ru | ||
| Sar | C3H05NO | ||
| Sb | Sb | ||
| Sc | Sc | ||
| Sec | C3H4NOSe | H | |
| Ser | C3H04NO2 | H | |
| Se | Se | ||
| SEt | C2H4S | H | SEt_subst_H |
| Si | Si | ||
| Sm | Sm | ||
| Sn | Sn | ||
| SO3H | HO3S | ||
| Sr | Sr | ||
| S | S | ||
| Sta | C8H15NO2 | ||
| StBu | C4H09S | ||
| Ste | C18H35O | ||
| Tacm | C6H12NO | ||
| Ta | Ta | ||
| Tb | Tb | ||
| tBu | C4H09 | tert.-butyl | |
| Te | Te | ||
| Tfa | C2OF3 | ||
| TFA | C2HO2F3 | ||
| Tha | C13H10N | H2 | 1,2,3,4-tetrahydroacridin-9-yl_when_substitued_two_site_substitution_is_considered_i_e_add_H_to_monosubstitued_one |
| Thi | C7H7NOS | beta-(2-thienyl)alanine | |
| Thr | C4H06NO2 | H | |
| Th | Th | ||
| Thx | C15H08NO3I4 | H | |
| Thz | C4H5NOS | thiazolidine_carboxilic_acid | |
| Tic | C10H8NO | H | |
| Ti | Ti | ||
| Tle | C6H10NO | H | tert-butyl-glycine |
| Tl | Tl | ||
| Tmob | C10H13O3 | trimethoxybenzyl | |
| TMS | C3H8Si | H | |
| Tm | Tm | ||
| Tos | C7H07O2S | ||
| Tpi | C12H9N2O | H | 1,2,3,4-tetrahydronorharman-3-carboxylic_acid |
| Trp | C11H09N2O | H | |
| Trt | C19H15 | ||
| Ts | C7H6O2S | H | |
| TyB2 | C9H06NO2Br2 | H | |
| TyBr | C9H07NO2Br | H | |
| TyI2 | C9H06NO2I2 | H | |
| Tyr | C9H08NO2 | H | |
| TyrI | C9H07NO2I | H | |
| U | U | ||
| Val | C5H09NO | ||
| V | V | ||
| W | W | ||
| Xan | C13H09O | ||
| Xe | Xe | ||
| Yb | Yb | ||
| YmoD | C13H14NO5 | OH2 | |
| YmoF | C18H18NO3 | H | |
| YmoI | C15H20NO3 | H | |
| Y | Y | ||
| ZBr | C8H06O2Br | ||
| Z | C8H07O2 | ||
| ZCl2 | C8H05O2Cl2 | ||
| ZNO2 | C8H06NO4 | ||
| Zn | Zn | ||
| ZOMe | C9H09O3 | ||
| Zr | Zr | ||